Högberg inkasserade nu sin första vinst sedan 15 februari.
Att han fick chansen mellan stolparna i nattens match berodde på att Senators dras med skador på förstemålvakten Matt Murray och andremålvakten Anton Forsberg.
Filip Gustavsson satt reserv bakom Högberg, så det var ett helsvenskt målvaktsteam.
Ottawa ligger sist i tabellen för North division och kommer inte att kvalificera sig till play off i vår, men det unga laget har imponerat under den andra halvan av säsongen.
– Det har varit enormt lärorikt och då inte bara att vinna några matcher här och där utan besegra en motståndare som är i desperat behov av poäng som Canucks ikväll, summerade forwarden Brady Tkachuk efter nattens vinst.
Mörkt för Vancouver Canucks
Med förlusten är Vancouvers chanser att nå slutspelet i vår väldigt små.
– Det är små marginaler mellan vinst och förlust den här tiden på året. Vi gjorde några misstag som kostade oss, analyserade Canuckstränaren Travis Green.
Josh Norris och Drake Batherson gjorde hemmalaget mål medan Olli Juolevi var Canucks ende målskytt.