Jagr snodde pucken av Ducksbacken Josh Manson framför motståndarkassen och kunde ensam framför John Gibson göra en dragning och lägga in pucken.
Anaheim skaffade sig en 1-0-ledning tidigt i den andra perioden när Andrew Cogliano i numerärt underläge använde sin speed och åkte ifrån Floridaspelarna innan han placerade skottet mellan benskydden på målvakten James Reimer.
Men precis som i tidigare matcher på senare tid hade Ducks problem att göra mål.
Jaromir Jagr har gjort 33 poäng i vinter
Panthers kom tillbaka med tre raka mål under mittenperioden av Colton Sceviour, Jagr och Aaron Ekbald och sedan kunde lagkaptenen Derek MacKenzie fastställa slutresultatet i tom kasse med knappt två minuter kvar av den sista perioden.
Jakob Silfverberg inledde matchen som vänsterforward i en kedja med Ryan Getzlaf och Ondrej Kase, men var tillbaka i sin vanliga roll på högerkanten med Cogliano och Ryan Kesler när den tredje perioden började.
- Vi slarvade och gav bort pucken några gånger i kritiska lägen, vilket Panthers utnyttjade, säger finländske backen Sami Vatanen, som nu var tillbaka i Ducksförsvaret efter fem missade matcher på grund av en skada.
För Florida ser det ljust ut sedan man fått tillbaka skadade anfallsstjärnorna Aleksander Barkov och Jonathan Huberdeau.
Man har vunnit sex av sina sju senaste matcher och ligger nu bara en poäng under slutspelsstrecket i Eastern conference.
Jagr har gjort 33 poäng, 11 mål och 22 assist, på 56 matcher i NHL i vinter.
Jagrs facit: 1901 poäng på 1685 matcher
Han ligger på fjärde plats i Floridas interna poängliga.
Jagr gjorde alltså sin 1900:e poäng i onsdags borta mot San Jose, samma dag som han fyllde 45 år.
Med sitt mål i nattens match är Jagr uppe i 1901 poäng, 760 mål och 1141 assist, efter 1685 matcher i NHL.
Se fler höjdpunkter på Viasatsport.se och matcherna live eller 48 timmar i efterhand på Viaplay.se.