Samtidigt spelade Örebro och Sirius oavgjort, 2–2, vilket innebär att Trelleborg, som fick kvala sig kvar i superettan i fjol, är vidare.
Fritiof Björkén avgjorde defintivt med sitt 3–1-mål i 80:e minuten.
TFF vann gruppen med två poängs marginal till Sirius och tre till Örebro.
Västerås SK tog hem grupp 1 genom att besegra superettankollegan Gais i den avgörande gruppspelsmatchen med klara 3–0 efter två sena mål. Viktor Prodell nickade in ledningsmålet i 23:e minuten och sedan kom Justin Salmons 2–0 i 90:e och Gustaf Lagerbielkes 3–0 på tilläggstid.
Storfavoriten och regerande svenska mästaren Malmö FF var redan borta från avancemang efter förluster både mot Västerås och Gais.
MFF avslutade i alla fall med en storseger, 4–1 hemma mot allsvenska nykomlingen Halmstad.