Resultattavlan visade 1-1 på Parc des Princes när Pochettino valde att byta ut Messi, med kvarten kvar att spela av den franska stormatchen mot Lyon.
34-åringen visade tydligt sitt missnöje med beslutet när han vandrade av planen, förbi tränaren och satte sig på avbytarbänken.
– Vi valde att byta ut Messi för att undvika en framtida skada. Vi har viktiga matcher framför oss och måste vara försiktiga med honom, säger Pochettino enligt Marca.
Han fortsätter:
– Sådan här beslut tas för lagets bästa, alla vet att vi har många fantastiska spelare och måste ta den här typen av beslut. Ibland uppskattas de och ibland inte.
Inhoppare avgjorde
När Messi passerade sin landsman i samband med bytet gav han honom en blick som tydligt meddelade att han inte uppskattade att bli utbytt. 34-åringen såg också ut att ”dissa” tränarens utsträckta hand och gjorde gestikulerade uppgivet, innan han satte på bänken och följde upplösningen på matchen.
Pochettinos matchcoachning går i efterhand inte att klaga på. En av inhopparna, Mauro Icardi, blev stor matchhjälte när han skickade in 2-1 på tilläggstid. Fullträffen innebär att PSG har inlett ligasäsongen med sex segrar och toppar Ligue 1, fem poäng före antagonisten Marseille som har en match mindre spelad.
