Eric Maxim Choupo-Moting gjorde fyra mål och Jamal Musiala hade gjort hattrick om inte en försvarare stött in bollen den sista vägen över mållinjen.
Bayern München hade lekstuga i tyska cupens 32-delsfinal borta mot Bremer SV som till vardags spelar i Oberliga Bremen.
Eric Maxim Choupo-Moting öppnade målskyttet med ett hårt skott via ribban i den åttonde minuten och därefter rann det på för de regerande ligamästarna.
I halvtid var resultatet 0-5 och målen fortsatte sedan rassla in direkt i den 47:e och 48:e minuten.
Bayern München fick ytterligare lite hjälp av ett rött kort i den 76:e minuten och vann till sist med 12-0. Det är klubbens största seger sedan 1997 då man besegrade DJK Waldberg med 16-1 i första rundan av tyska cupen.