IFK Norrköping, FK Krasnodar och Jón Guðni Fjóluson bekräftade tidigare i veckan att 29-åringen var nära spel i den ryska klubben.
Nu har övergången bekräftats.
– Vi är oerhört glada för Jons skull att han får denna möjlighet att ta sig vidare i karriären. Vi tackar Jon för hans insatser och önskar honom ett stort lycka till, säger IFK Norrköpings manager Jens Gustafsson till klubbens hemsida.
Fjóluson kom till Norrköping från Sundsvall säsongen 2016 och har i år gjort totalt sex mål för klubben.
Den isländske mittbackens nya kontrakt sträcker sig över tre år.
