Problemen beräknas pågå hela dagen, skriver SL på sin hemsida.
Trafiken mellan Upplands Väsby och Märsta på linje 41 är helt inställd under fredagen.
Tågen på linje 40 i riktning mot Uppsala C och Södertälje kommer i stället stanna vid Rosersberg och Märsta, skriver SL på sin hemsida.
Även tågtrafiken mellan Västerhaninge och Nynäshamn har ställts in, och ersätts av bussar en gång i halvtimmen. Dessa kommer inte stanna vid Hemfosa – utan resenärer till och från stationen hänvisas till alternativa färdmedel och SL:s förseningsersättning.