Utbrottet är det största i Kina sedan juni, rapporterar South China Morning Post.
Det handlar om 137 bekräftade fall på en tygfabrik i staden. Alla har koppling till en tonårig flicka, vars föräldrar jobbar på fabriken.
På lördagskvällen startades en stor masstestning på alla 4,7 miljoner invånare i Kashgar. På söndagseftermiddagen har över 2,8 miljoner människor testats.
Skolor ska hållas stängda
Enligt kinesiska myndigheter har 334 800 provresultat hunnit registreras, och man säger sig inte ha hittat några fall som inte är kopplade till fabriken.
De 137 personer som bekräftats positiva har alla varit symtomfria.
Sedan utbrottet uppmärksammades har invånarna i Kashgar beordrats att inte lämna sina egna kvarter, medan masstestningen pågår. Kollektiv- och flygtrafik ställdes in till och från staden på lördagen, och skolor har ombetts att hålla stängt, skriver South China Morning Post.
Däremot tillåts de som testats negativt att lämna staden.
Fyra regioner i staden har utlysts som ”högriskområden”, skriver Reuters.
Till Sotuh China Morning Post säger en invånare att hon blev uppringd av en lokal kommitté på lördagen, om att tester skulle utföras under natten, men att hon inte fått veta att ett kluster av coronaviruset brutit ut i staden.