Kraschen ska ha skett på Norrviksleden strax norr om Sollentuna, enligt räddningstjänsten.
Larmet kom in strax efter 7 på morgonen.
MC-förare till sjukhus
Motorcykelföraren fördes till sjukhus med oklara skador, enligt Johan Winsnes, ledningsbefäl vid räddningstjänsten i Stockholm.
Det är oklart huruvida bilföraren har förts till sjukhus.
Trafiken avstängd
Trafiken på Norrviksleden är avstängd i norrgående riktning, enligt Johan Wisnes.
– En timme till tror de, säger Johan Wisnes vid 07:45 på torsdagen.
Två bärgare är beställda till platsen, enligt polisen.