Helikoptern, som sköts ned i måndags, var en av två som var ute på ett uppdrag för att koordinera en humanitär hjälpinsats. Det skedde efter att rebellgruppen M23 attackerat en serie byar i området, enligt ett uttalande från militären.
Soldater från den kongolesiska armén och FN söker efter helikoptervraket och överlevande.
Flera väpnade grupper rör sig i de mineralrika områdena i den östra delen av landet, som länge varit krigsdrabbat. M23-rebellerna har på senare tid ökat sina attacker i regionen.
