Polisen uppger att branden under onsdagskvällen tilltagit och räddningstjänsten har ingen kontroll.
Under natten har branden fortsatt rasa medan ett räddningsfartyg med en vattenkanon försökt släcka den på avstånd, rapporterar NRK.
På torsdagsmorgonen rapporterar Dagbladet att fartyget har kantrat.
Röken hotar närliggande sjukhus
Polisen befarar nu att röken kan hota patienter på närliggande Universitetssjukhuset Nord-Norge. Vid 09-tiden på morgonen utvärderar sjukhusledningen huruvida planerade operationer kommer att behöva ställas in.
Utöver det finns även en risk att anställda inte kommer fram, eftersom ett undantagstillstånd utfärdats för trafiken på vägar i närheten av brandhärden.
– Ledningen sitter i möte och det finns en möjlighet att avdelningar måste stängas och avtalade behandlingar skjutas upp. Vinden från branden har vänt på senare tid, men problemet är att det kan komma in rök via ventilationsanläggningen, som inte kan stängas av utan att påverka viktiga funktioner, säger sjukhuskommunikatören Jørn Resvoll till Dagbladet.
På grund av röken håller gymnasiet Ishavsbyen stängt under torsdagen.
Branden i Tromsö inte under kontroll
Polisen ställdes på onsdagen inför två alternativ, berättar Morten Pettersen vid norska polisen för Dagbladet.
– Det ena är att vi evakuerar alla inom en säkerhetszon på 300 meter runt båten. Det andra är att hitta en lösning och sänka båten där den ligger för att kyla den och släcka elden.
Senare på kvällen beslutade polisen att evakuera 92 personer som bor inom 300 meters avstånd från fartyget.
– Det är mycket ammoniak ombord och vi har inte kontroll på branden. Det ökar explosionsrisken avsevärt, säger Ola B. Sæverud, polischef i Troms, till NRK.
”En mycket olycklig situation”
Enligt NRK finns det runt 200 000 liter diesel ombord på trålaren. Dessutom finns där även ammoniakbehållare som räddningstjänst inte kan komma åt på grund av branden.
– Om den skulle explodera vore det en mycket olycklig situation, säger Morten Pettersen.
Den extrema värmen gör att brandmännen tvingas hålla sig på avstånd, vilket gör släckningsarbetet svårare.
Ombord på trålaren fanns inledningsvis en besättning på 29 personer – men samtliga var satta i säkerhet vid 12.30-tiden på onsdagseftermiddagen. Branden bröt ut vid 11-tiden i samband med att trålaren lade till vid kajen.