Konduktören som kastade av den elvaåriga flickan i Kumla togs på onsdagen ur tjänst.
Nu riktar facket skarp kritik mot bolaget för att ha pekat ut en enskild anställd som skyldig.
Samtidigt försvarar huvudskyddsombudet på SJ SEKO, Lennart Jansson, konduktören.
- I det läget hon var i då har hon gjort rätt bedömning, säger han till Sveriges Radio.
Nyheten om att en elvaårig flicka kastats av tåget när hon saknade biljett väckte på onsdagen stor uppmärksamhet. SJ valde omgående att ta den kvinnliga konduktören ur tjänst. Men nu går fackförbundet SEKO till hennes försvar.
- Jag tror att den här personen som har gjort det här har gjort en bedömning. Och då när man gör den bedömningen är det rätt bedömning. Sedan i efterhand kan man kanske kritisera. Men i det här läget som hon var i då har hon gjort rätt bedömning. Hon har gjort bedömningen att flickan är äldre än elva år, säger Lennart Jansson till SR.
Samtidigt är facket kritiskt till hur SJ har handlat.
"Populistiskt agerande"
- Vi tycker att SJ:s agerande är populistiskt och under all kritik. De ägnar sig nu åt att leta en syndabock och lägger allt ansvar på en enskild anställd utan att ha alla fakta på bordet, säger Erik Johannesson, ordförande för SEKO:s förhandlingsorganisation inom SJ, i ett pressmeddelande.
SJ:s presschef Dag Rosander sade till Expressen.se på onsdagen att företaget har en policy för hur personalen ska agera vid liknande händelser.
- Vi har instruktioner som vi tycker är ganska tydliga, sade Rosander.
Enligt facket lades dokumentet under gårdagen ut på SJ:s intranät. "SEKO har dock aldrig tidigare sett detta dokument, inte heller flera SJ-anställda som SEKO varit i kontakt med det senaste dygnet", skriver man.
– Vår uppfattning är att SJ nu gör en efterhandskonstruktion för att rädda företagsledningens ansikte och kunna skylla på en enskild anställd, säger Johannesson.
"Alltid kontakta polisen"
Nu kommer SEKO att uppmana sina medlemmar att kontakta polisen när liknande händelser inträffar.
– Vi kommer att uppmana våra medlemmar att alltid kontakta polisen när den här typen av situationer uppstår och resenärer saknar färdbevis. Annars riskerar det att bli fel och vi vill inte att våra medlemmar ska bli uthängda på det här sättet fler gånger, säger Lennart Jansson, arbetsmiljösamordnare i SEKO:s förhandlingsorganisation inom SJ, i pressmeddelandet.
- De skrivna reglerna är tydliga. Vi delar inte fackets uppfattning, säger Dag Rosander, presschef på SJ till TT.
Rutinerna ingår i den grundutbildning som all ombordpersonal får och de anställdas ansvar att känna till rutinerna, enligt Rosander.
- Vi är självklart inte ute efter att sätta dit någon eller hänga ut någon för det här. Vi vill att det ska vara lätt för våra anställda att jobba utan att detta händer igen.