Isaak har suttit fängslad i Eritrea sedan 2001 utan rättegång. EU-parlamentet har tidigare uttryckt sin oro för behandlingen av Isaak och krävt att han ska friges.
De andra nominerade är Izzeldin Abuelaish, palestinsk gynekolog som arbetar för fred mellan israeler och palestinier, och Ludmila Aleksejeva, Oleg Orlov och Sergej Kovaljov, ryska människorättsförkämpare och företrädare för organisationen Memorial, som en gång startades av Andrej Sacharov.
Den 22 oktober kommer gruppledarna för parlamentets olika partigrupper att utse en vinnare och 16 december är det prisutdelning i Strasbourg.